A Orde Hospitalaria de San Xoán de Deus, con case cinco séculos de existencia, estivo atenta ás necesidades socio-sanitarias de cada época e lugar. Por isto, a finais de 1935 iniciou en Vigo a construción dun Fogar e Clínica que dese cobertura ás necesidades dos nenos e nenas afectados de secuelas da Poliomielite e malformacións físicas derivadas doutras doenzas.

Anos máis tarde, ao ir desaparecendo en gran parte as necesidades iniciais, o sector da Educación Especial atopou eco nos Irmáns de San Xoán de Deus e por iso, dende o inicio da década dos sesenta, este Centro viu realizando a súa actividade e afondando na atención a persoas con discapacidade intelectual nas áreas educativa, ocupacional e residencial. Co desexo de ofrecer mellores servizos aos nosos usuarios e usuarias e aumentar os niveis de calidade asistencial, fóronse realizando adaptacións estruturais coas que se dotou ao Centro dunhas instalacións modernas e confortábeis que nos permiten seguir traballando no obxectivo da asistencia integral baseada nos principios de integración, normalización e atención á diversidade.

O Fogar e Clínica de San Rafael, Centro de atención a discapacitados psíquicos e de rehabilitación, ten carácter asistencial de confesionalidade Católica promovido para o cumprimento dun servizo público con xestión privada sen ánimo de lucro. Como tal Centro asistencial, sométese ás disposicións emanadas da lexislación vixente sobre a materia, tanto do Estado español, como da Comunidade Autónoma de Galicia.

Así mesmo, como Centro pertencente á Orde Hospitalaria de San Xoán de Deus, sométese ás disposicións das Constitucións e Estatutos Xerais da Orde Hospitalaria de San Xoán  de Deus. Como Centro Católico atense en todas as súas actividades á ética natural e á moral católica.

O Centro está aberto a toda persoa que necesite asistencia, calquera que sexa a súa condición relixiosa, social, ou económica, sen máis limitacións que as que se deriven das propias características específicas do Centro, as cales son de público coñecemento. A nosa meirande ledicia é que nos visitedes. Veredes os nosos traballos, actividades e instalacións. Comprobaredes como procuramos que os nosos usuarios e usuarias participen activa e normalmente na vida social, laboral e cultural da nosa contorna.

A misión do Fogar e Clínica San Rafael ten unha dobre orientación en base ao carisma da hospitalidade ao estilo de San Xoán de Deus: